原创《小麦D基因组完整图谱首绘成功》
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据中国农科院最新消息,该院作物科学研究所研究员贾继增领衔的研究团队,在小麦D基因组测序研究中,揭示了转座子（TE）在小麦基因组中的重要功能,完成了染色体级别的D基因组精细图谱的绘制,并首次获得一个完整的整合图谱.相关研究论文11月20日在线发表于《自然·植物》期刊上.
贾继增介绍,小麦是世界最重要农作物之一,基因组巨大而且复杂,和其他作物相比转座子含量特别高.这使得小麦基因组测序组装异常困难.粗山羊草是小麦D基因组供体种,对小麦品种改良非常重要.该研究团队在2013年完成了粗山羊草基因组草图的绘制,研究成果在《自然》上发表,4年多来已被引用412次,成为小麦研究领域高被引论文之一.然而受当时技术条件所限,研究的深入与基因组信息的利用不足.
近年来,该团队利用二代、三代等测序技术与最新的组装技术,对D 基因组重新测序和组装,将组装质量提高210倍,完成了染色体级别的D基因组精细图谱的绘制.利用高质量的组装结果,准确地进行了基因注释,构建了基因分布图、基因表达图、假基因分布图、重复序列分布图、化分布图、重组率分布图和allRNA分布图.研究发现,粗山羊草基因组中有一批基因在近期发生了复制.
研究还重点分析了TE对基因组结构、基因复制、假基因形成与基因表达的影响,发现有近1/2的基因中携带有TE,是已测序基因组中携带TE基因最多的物种,也是迄今为止报道的假基因数量最多的物种.TE通常还抑制基因的表达.
(来源：科技日报)
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